安徽医科大学第一附属医院是安徽省规模少有的综合性教学医院，集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体。前身为上海东南医学院附属东南医院，创办于1926年。1949年内迁至安徽怀远县，1952年迁至合肥市。1993年成为卫生部首批三级甲等医院。2011年进入中国极佳医院80强排行榜。
医院开放床位2582张，设临床科室41个，医技科室19个，临床教研室26个。年门诊量215余万人次，年住院病人10.6万人次，年手术4.1万台次，年教学工作量约1.7万学时，年接收实习生、进修医生1000余人。2011年1月，建筑面积约30.7万平方米、开放床位近2000张的高新分院项目签约，预计2013年正式投入使用。
医院是临床医学博士学位授权一级学科点，临床医学博士专业学位研究生培养单位，1个临床博士后科研流动站，硕士学位点覆盖所有的临床科室。拥有重点学科1个，国家临床重点专科7个，安徽省重点学科6个，安徽省临床医学重点学科、重点发展学科和重点扶持学科25个。拥有国家重点实验室培育基地1个，教育部重点实验室1个，省部级共建重点实验室1个，省级重点实验室4个。
医院拥有博士生导师51人，副高职称以上专家660余人，博士和在读博士200余人，硕士380余人，享受国务院和省政府特殊津贴120人，担任省级以上医学学术团体负责人60多人，有7人入选全国"百千万人才工程"，6人被国家人事部、卫生部授予“有突出贡献的中青年专家”，省厅以上跨世纪学术技术带头人、骨干教师100余人。