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二手房买卖问题

看中一个二手房，中介带着看的。当时跟中介交5000块的定金，签了意向书，房子总价83万，意向书中补充说明了中介费13000元。 这个房子有点问题，起先是一个女孩买了这个房子，签了居间合同，买卖合同，给房主付了一万的定金。后来女孩想要个两居（此房为一居），又不想承担违约责任，所以让中介再找个买家。
当时中介让我看了他们签的合同，还把女孩的手机号给了我，我跟女孩联系后，发现此女孩跟我在同一个公司，她也确实不想买这个房子了，她跟中介的说法一致，我就跟中介签了意向书。当时中介答应，从新跟我和房主签居间合同买卖合同。 后来女孩买到两居，约我和房东办理贷款事宜，此时房东还不知道这事。
这时中介要求瞒着房东，能瞒多久就多久，签字让我签，我当时不同意，房主必须同意后我才会打首付，中介和那女孩（暂且叫二房东）怕房东告他们违约。 我要求，中介和女孩，我写了个声明，由我代替二房东执行下面的购房流程。他们三方的居间合同由中介收齐后给我。 后来房东来了，中介说我和二房东关系不错，二房东的资格审核没通过，由我代替执行。
房东挺好说话的，同意了，我就办了贷款，网签，付了首付给房主。同时给了二房东5000，连并先前给中介的5000定金算是偿还给二房东给房主的一万定金。 现在我和房主办了网签，签了贷款协议，还没到初审这步。我手里有和中介签的意向书，二房东，我，中介签的一个声明。还有他们三方签的居间合同，买卖合同。
现在的问题：（1）我没有纸质签居间合同，买卖合同，总觉得没保证，我跟中介提出重新签一份，中介不干，还跟我们吼起来，说没事，态度很嚣张，还说要长中介费，当时我们的中介费已经在意向书中写明了。 没有纸质签居间合同，买卖合同，会有啥问题。如果过户完成后，这些合同还有什么用处？（2）中介要要回他们三方签的居间合同，买卖合同，说由他保管，我没同意。
我觉得这是砝码，中介这么猖狂，是不是有这个合同在就可以说明他是一房两卖？ 对我的交易也是个保障。 （3）房子过户后，我是不是可以要求和房主，中介补签居间合同，买卖合同？。