大连市儿童医院创建于1952年6月1日。经过几代儿医人的艰苦奋斗，医院现已成为一所学科门类齐全、师资力量雄厚、医疗技术精湛、诊疗设备先进的辽南地区规模最大的综合性儿童医院。担负着大连市及辽南地区18岁以下170万儿童的医疗、康复、预防、保健任务，是辽南地区的儿科医疗中心。2013年2月6日，正式揭牌成为了大连医科大学附属大连市儿童医院。
医院位于大连市西岗区中山路154号，市中心希望广场西侧，占地面积约9000余平方米，建筑面积3.1万余平方米。现有编制床位400张，实际开放床位425张，职工783人，卫生专业技术人员655人，占全院职工总数的82%，其中主任医师/技师34人，副主任医师/护师59人，中级卫生技术人员190人，初级卫生技术人员372人。
全院设内科、外科、麻醉科、重症医学科、康复科、儿保科、皮肤科、口腔科、耳鼻喉科、眼科、中医科等临床科室。院外还设有山东路分部、八一路分部和红旗路门诊部。全院设有13个病房，其中内科9个病房，外科2个病房，心脏综合病房1个，康复科1个;重症医学科设急诊室和ICU;医技科室设有药剂、检验、放射、超声等科室。
目前，医院拥有辽宁省重点专科1个——中西医结合儿科，大连市快速提升医疗软实力建设项目小儿心脏病诊疗基地1个，大连市一级重点学科4个：小儿呼吸内科、小儿康复医学科、小儿胸心外科、新生儿科，院级医学重点学科2个：神经内科、血液科，院级医学重点专科1个，小儿重症医学科。
医院担负着大连医科大学和大连大学医学院儿科教学、实习任务，大连医科大学留学生授课任务。系辽宁省高等医学院校教学医院，大连医科大学、延边大学“研究生培训基地”，辽宁省首批儿科、儿外科住院医师规范化培训基地。其中大连医科大学兼职硕士生导师5人，延边大学兼职硕士生导师5人。现有兼职教授19人、副教授31人。医院现在国家一级学会专科分会担任常务委员、委员及学组成员10人，辽宁省医学会专科分会等担任副主任委员5人、委员8人，大连市医学会儿内、儿外分会主任委员2人、委员20余人。
医院重视人才培养和合作交流，近年来医院积极推进“走出去、请进来”的人才培养策略。开展多渠道、多领域的国际和国内交流合作，先后与韩国忠南大学医科大学、俄罗斯联邦萨哈共和国医疗中心儿童医院、萨哈共和国雅库茨克市儿童医院、日本福冈市立儿童医院、韩国延世大学世博兰斯儿童医院签署了友好合作协议，与北京儿童医院、复旦大学附属儿科医院、广州市妇女儿童医疗中心、湖南省儿童医院建立了友好合作医院。并多次邀请国内外专家学者来院讲学、洽谈合作项目等，以推动科研、临床发展。同时选派医护人员赴美国、加拿大、韩国、香港等国外境外及国内一流院校进行深造，在提高医务人员的学术水平的同时还注重引进优秀人才，以推动和加快医院学科建设，提高医院综合竞争实力。
多年来，医院坚持科技兴院的道路，制定科研管理和奖励办法，每年拨出科研专项经费，做到立项课题到位、科研经费到位、奖励落实到位，为各项目获取成果创造条件。近年来，承担各级各类科研课题50多项，开展新技术100多项，获中国中西医结合学会科学技术奖1项，中华中医药学会科学技术奖1项，辽宁省科学技术奖4项，大连市科学技术奖5项。2010年医院成功创办了内刊——《小儿呼吸与危重症》电子期刊。先后在人民卫生出版社、辽宁省科学技术出版社出版了《儿科常用注射药物手册》、《儿科疾病临床诊治指南》、《儿童心电图快速查阅手册》、《儿童健康知识232问》。
近年来，医院先后荣获了大连市文明单位、辽宁省应急工作先进单位、大连市应急工作先进单位、全市卫生系统先进、大连市药品安全性监测工作先进单位、中国医院信息化先进单位集体等荣誉称号。
大连市委、市政府十分重视大连儿童医疗健康事业的发展，为了缓解看病难、住院难问题，2011年将儿童医院院区改造列入今年政府为民办实事项目，投资8.7亿元，原址改扩建，改造后的儿童医院院区占地面积将由9700平米增加到1.3万平方米，总建筑面积由3.1万余平方米增加到12.2万余平方米，床位由400张增加到800张，新增停车位700个，预计2015年后投入使用。两至三年后，一座立足大连，辐射东北甚至全国的现代化综合性大连市儿童医院，将以全新的面貌呈现在世人的面前。