上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心（简称“儿中心”）是由上海市人民政府与世界健康基金会（Project HOPE）合作共建的一所集医、教、研于一体的三级甲等儿童专科医院。1998年6月1日医院正式开张，前国家主席江泽民同志为医院题写院名，美国前总统夫人希拉里 · 克林顿女士为医院开张剪彩，2011年，美国新任驻华大使骆家辉先生到访医院，将儿中心誉为“中美医学成功合作典范”。
医院占地面积100亩，总建筑面积约8.4万平方米，规模床位1000张，实际开放床位604张，重症监护床位数配置占总数的1/5。目前，年门急诊总量约140万人次，出院病人约2.2万人次，手术病人约1.3万人次，门急诊、日间手术0.7万人次。2010年，儿中心成为国内首家通过JCI国际医院认证的儿童专科医院。2013年顺利通过JCI复评审，成为首个通过JCI教学医院的儿童专科医院。2012年，医院获得国家药物临床试验机构资格认定证书，共8个专业获得药物临床试验专业资格。此外，医院拥有多个在国内外具有重要影响力的优势特色学科。心脏手术量每年逾3700例，手术最小年龄为生后6小时，最轻体重800g；心导管术1400余例。在国内率先开展大血管调转术、先心病合并气道狭窄根治术、双调转手术、儿童永久起搏器植入术以及胎儿心血管超声、核磁共振检查等多项新技术并在全国推广。儿童血液肿瘤中心每年收治新发白血病及肿瘤病例450余例，累计完成各类疑难重症的造血干细胞移植近500例。儿童保健（发育行为儿科）专业是我国该学科领域的发源地之一，近年来学科在注意缺陷多动症、孤独症等发育行为儿科疾病率先进行了医教结合干预模式，同时团队在铅中毒、新生儿听力筛查和儿童睡眠健康项目中有效实现了科学研究向公共卫生政策的转化，获得了三项国家科技进步二等奖，同时得到了国际同行的高度认可。
医院作为上海交通大学医学院的附属医院，儿科学专业已经成为国家重点学科、211工程、985工程、085工程重点建设学科，相关儿科亚专业相继获得国家临床重点专科、上海市医学重点学科及上海市公共卫生重点学科等。医院还设有国内首家儿科转化医学研究所、卫生部重点实验室、卫生部首批小儿先天性心脏病诊断和介入治疗继续教学的培训基地、上海市小儿先心病研究所、上海市首批临床医学中心，以及儿童听力、儿童血液肿瘤、注意力缺陷、呼吸循环、小儿肝病、儿童癫痫、儿童睡眠障碍等多个研究所及临床诊治中心。 15年来，先后获得国家科技进步二等奖5项 （合作2项）， 多次获得上海市科技进步一等奖、中华医学会科技进步奖、教育部科技进步奖、宋庆龄儿科医学奖等重大科研奖励。
近年来，医院引进并培养了一批学科骨干，获得中央千人计划、上海市千人计划、国家优青、东方学者、卫生系统领军人才等各类人才资助计划。医院设有儿科专业博士后流动站、博士、硕士培养点，也是上海市儿科住院医师规范化培训的主要基地之一。
医院先后与30余个国家和地区的医疗机构，包括与23个世界最具影响力的儿童医院建立了友好合作关系。此外，医院秉着“培训—培训者”的理念，连续十年开展“西部及东北地区儿科医护人员培训项目”，免费为西部及东北部边远地区18个省、53个城市培养了273名儿科人才。医院在国内率先设立医务社会工作部，建院以来共有近万名患者获得资助和治疗。