乌鲁木齐市妇幼保健院始建于1951年，1996年加挂自治区妇幼保健培训中心，2003年加挂乌鲁木齐市妇产医院。位于乌鲁木齐市解放南路344号，现已是新疆规模少有的集预防、保健、医疗、科研、教学、培训为一体，专科特色最突出的三级妇幼保健机构。
是全疆新型农牧区合作医疗定点医疗机构；新疆维吾尔自治区医疗保险定点医疗机构；新疆生产建设兵团医疗保险定点医疗机构；乌鲁木齐市医疗保险定点医疗机构；城镇职工生育保险定点医疗机构；商业保险定点医疗机构。同时与国内外多家一流的医疗机构、医学科研机构建立了长期广泛的技术合作和学术交流机制。承担全疆的妇幼保健组织管理、技术指导及业务培训工作。
目前，乌鲁木齐市妇幼保健院占地面积4338.74平方米；建筑面积15266平方米，开放床位200张。医院拥有职工483名，专业技术人员398人，其中高级技术职称人员69人，中级技术中称人员28人，硕士研究生19人。医院下设科室26个，设有产前筛查中心，产前诊断中心，新生儿疾病筛查中心，新生儿重症转运中心，重症孕产妇救治中心等。
妇女保健科：设有青春期保健室，男女婚检室，女性心理健康保健室，孕前保健室，产后保健室，妇女健康体检室，骨质疏松诊治室，乳腺疾病诊治室，围绝经期保健室等，提供女性一生的生殖健康保健服务。防宫颈癌和乳腺癌健康体检是我们的特色。
儿童保健科：设有儿童生长发育监测室，营养评估与电脑评价室，心理行为测评室，智力筛查室，早期干预室，口腔保健室，听力筛查室，眼保健室，计划免疫室、儿童保健健康教育室等，为０－７岁儿童提供有效的生长发育及健康保健服务。
妇科：开展了腹腔镜，宫腔镜，阴式手术，射频，利普治疗术，超声聚焦治疗，中药导入治疗，肠道治疗，阴道镜检查，液基细胞检查，宫颈高危形ＨＰＶ感染检测，生殖道感染源的ＰＣＲ检测等。
产科：分产一科（生理产科）、产二科（病理产科）、产三科（生理产科）、产房、产前诊断中心五个部门，拥有医护人员约140人，开展了产前诊断、胎儿畸形筛查、妊娠期糖尿病诊治等领先医疗服务。实行一条龙服务；有全疆首创的“助产超市”；有深受准爸爸、准妈妈欢迎的孕妇沙龙、孕妇学校；有别具特色的导乐式分娩、分娩镇痛、陪伴分娩；有促进婴儿生长和智力发育的新生儿抚触，新生儿水疗。这里有全疆少有规模的产科病房和产科分娩室，有一支全疆首批获全国青年文明号的助产士们为您提供亲情服务。
产前诊断中心：业务范围包括产前筛查（唐氏儿筛查），产前诊断（外周血染色体、羊水染色体、脐血染色体等），新生儿疾病筛查（苯丙酮尿症、先天性甲状腺机能低下筛查等），常见遗传病的检测及咨询。
产后恢复中心：开展了产后子宫复旧，产后卵巢复旧，阴道弹性恢复，产后乳腺疏通，产后疲劳恢复，足疗反射疗法，中药足浴以及产后光波治疗等项目。
新生儿科：能同时接收40多名高危新生儿入住观察治疗；是乌鲁木齐市新生儿重症转运中心，开展了新生儿疾病筛查与相关治疗。新生儿科拥有床旁新生儿头颅B超，高频震荡呼吸机，CPAP无创呼吸机，多功能监护仪，红外线辐射台，暖箱及蓝光箱，微量注射泵，床旁X光机等先进设备。
乌鲁木齐市妇幼保健院拥有万元以上仪器设备289套，配备了GE的E8、L9、多台V730彩色B超、VV7心脏彩超以及飞利浦的IU33心脏彩超、时间荧光分辨、全自动染色体分析仪、PCR扩增仪、乳腺钼靶X光机、微创乳腺旋切系统、全自动多功能产床、产科中央监护、全自动生化仪、全自动血凝仪、全自动酶标仪、全自动细菌检测仪、荧光显微测试系统、电化学发光仪、微量元素光谱分析仪、阴道镜、宫腔镜、腹腔镜、射频治疗、超声刀、血管结扎束等高、精、尖诊疗设备。
教学、培训方面，乌鲁木齐市妇幼保健院是“中国优生优育基因检测健康指导项目新疆地区临床示范基地”，“新疆维吾尔自治区妇幼保健培训中心”，“卫生部职业技能鉴定指导中心职业培训基地”，“新疆医科大教学基地”，“昌吉卫校教学基地”，“现代护理学院教学基地”。
多年来，乌鲁木齐市妇幼保健院先后荣获全国“青年文明号”、全国“巾帼文明示范岗＂、自治区文明单位、自治区行风示范窗口、乌鲁木齐市价格诚信单位等国家、省部、市级的各种荣誉60多项。
乌鲁木齐市妇幼保健院实现了电子一卡通就医，全程导医服务，网络化管理，电子处方，极大方便了患者就医。2008年门诊量达300000人次，出院病人近13000人次。2006年9月12日我院新综合楼获准立项，总建筑面积30000平方米，2009年交付使用。医院拥有强大的技术力量及先进的医疗设备，坚持“人性化、细微化、科学化、规范化”的服务理念，竭诚为广大妇女儿童及社会各界人士提供一流的医疗保健服务。