新疆煤矿总医院位于乌鲁木齐市沙依巴克区南昌路9号，是国家二级甲等医院和爱婴医院，是自治区、乌鲁木齐市和新疆生产建设兵团医疗保险定点机构。
现隶属新疆乌鲁木齐矿业（集团）有限责任公司。医院始建于1958年10月，期前身是中国人民解放军总后勤部第二预备学校（成都军区第三军医学校）门诊部。经过40余年的建设，现已发展成在编床位310张、25个科室及职业病、骨质疏松两个研究所的多功能综合性煤矿职工医院。
新疆煤矿总医院拥有德国西门子CT机、西门子B超机、日本岛津1000mA多功能X线机、美国产腹腔镜、日立全自动生化分析仪、德国产高频电刀、美国产前腺气化电切镜、美国产膀胱镜、英国产多功能麻醉机、日本产电子胃镜、美国产无创起搏除颤心电监护仪、彩色多普勒、法国产呼吸机、美国产多功能监护仪等一批较为先进的大中型骨干设备，为临床诊断与治疗提供了良好的辅助检查与治疗手段。
新疆煤矿总医院在职职工297人，220名卫生专业技术人员中，高、中级专业技术职称者占35.9%。科室专业设置包括内科（心血管、内分泌、神经内科、呼吸、消化、肾病、血液病科）、外科（普外、烧伤、泌尿、胸外、神经外科、肿瘤）、骨科、脊柱外科、儿科、职业病科、妇产科、脑外科、干部病房等。
新疆煤矿总医院大部分病房内部都设置了洗手间，配置了淋浴设施；手术室设有一流的重症监护市，确保了危重手术病人的术后安全。在全院20多个专业中，重点科室骨科对于骨科常见病、多发病的诊治，在全疆享有一定声誉。医学影象科开展的子宫输卵管再通术疗效显著；脑外科可运用手术治疗癫痫，并运用显微外科技术开展断指再植。
职业病研究所于1992年在西北五省率先引进全肺大容量灌洗术治疗各种尘肺获得成功；1994年成立的骨质疏松研究所，是区内较早开展骨质疏松防治的专门研究机构。目前，该院在尘肺病和骨质疏松病的诊治领域居全疆领先水平。
新疆煤矿总医院是自治区级文明单位和乌鲁木齐市卫生红旗单位，现占地面积为60255.70m，总绿化面积达45%，环境幽雅，交通便捷，17路、907路可直达医院，是治疗、休养的理想场所。