厦门大学附属中山医院创建于1928年，由爱国华侨和地方知名人士为弘扬中山先生“天下为公，造福社会”的精神捐资兴建而成。时任厦门大学校长、医学专家林文庆博士出任首任院长。创建初期，医院开放床位150张，设内科、外科、妇科、儿科和五官科、皮肤病等科室，并创办一所高级护士学校，奠定了医教一体的医院格局。抗战与文革时期，医院历经沦陷和撤并等磨难。1980年10月，厦门经济特区成立，中山医院恢复重建，1988年重新开诊接收病人。目前，已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级甲等国家重点大学附属医院。
医院现有床位1600张，教职员工2200余名(含高级专家350人，硕士、博士以上学历300余名)。年门、急诊量达187万余人次，收住病人近4万人次。设有35个临床学科、10个医技科室、3个分部、4个社区医疗中心。拥有厦门心脏中心、厦门临床检验中心，厦门大学消化疾病研究所、厦门大学器官移植研究所、厦门市老年医学康复研究所等研究机构。消化内科、肝胆外科、神经内科、神经外科、心内科、心外科、骨科等7个学科为市级重点学科;血液科、老年病康复科、病理科、皮肤科等4个学科为市级规划重点专科;急救医学、妇产科、呼吸内科、肾内科、耳鼻喉科、口腔科、整形外科等学科为市优势学科。配备有国际一流水平的64层螺旋容积CT、1.5T双梯度超导核磁共振仪、直线加速器、伽马刀、罗茨双模块全自动生化分析仪、数字双屏板双C臂血管造影机以及ECT、DSA、DR、彩色B超、血液透析机、双气囊电子小肠镜、超声电子内窥镜等现代化仪器设备，设备总值达3.5亿元。
医院设有《诊断学》、《内科学》、《外科学》、《妇产科学》、《儿科学》等12个教研室。内科学、外科学为二级学科硕士学位授予点。拥有一支200余名的教师骨干队伍，以教授、副教授、研究生导师为主要力量。承担厦门大学、福建医科大学等省内外医学院校包括留学生在内的医学临床教学任务以及临床医学研究生的培养工作，2006年，经国家人事部严格遴选，我院以优异的成绩由国家人事部批准设立厦门大学附属中山医院博士后工作站。目前拥有包括国家自然科学基金在内的国家级、部省级等各类科研项目已超过200余项。每年发表医学科技论文数百篇，其中被SCI源期刊收录的数十篇。
医院职工积极开展精神文明建设，秉持“团结、敬业、求实、创新”的医院精神，坚持“以病人为中心”的宗旨，在医院改革和管理、精神文明和政治文明建设方面取得可喜成果，连续多次被评为省、市文明单位。2003年度被评为福建省抗击非典先进集体、2004年荣获全国卫生系统先进集体、2005年被评为国精神文明建设工作先进单位、2008年获得厦门市五一劳动奖状和福建省抗震救灾先进集体等光荣称号。
配备有国际一流水平的64层螺旋容积CT、1.5T双梯度超导核磁共振仪、直线加速器、伽马刀、罗茨双模块全自动生化分析仪、数字双屏板双C臂血管造影机以及ECT、DSA、DR、彩色B超、血液透析机、双气囊电子小肠镜、超声电子内窥镜等现代化仪器设备，设备总值达3.5亿元。
目前拥有包括国家自然科学基金在内的国家级、部省级等各类科研项目已超过200余项。每年发表医学科技论文数百篇，其中被SCI源期刊收录的数十篇。
连续多次被评为省、市文明单位。2003年度被评为福建省抗击非典先进集体、2004年荣获全国卫生系统先进集体、2005年被评为国精神文明建设工作先进单位、2008年获得厦门市五一劳动奖状和福建省抗震救灾先进集体等光荣称号。