常见者为单纯疱疹病毒，巨细胞病毒及肝炎病毒感染。Ⅰ型单纯疱疹病毒主要累及口腔，表现为吞咽痛，厌食及发热等；Ⅱ型单纯疱疹病毒主要累及肛门，可表现为肛门直肠疼痛伴分泌物，也可出现腹泻或便秘。与肠黏膜表面接触的性行为可传播多种病毒，包括肝炎病毒，甲型肝炎在男性同性恋中发病较高，乙型和丙型肝炎可通过各种性行为传播。
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