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如何选择蛋白数据库?

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目前来说,用的最多的是UniProt KB(Universal Protein),是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。他的数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列,每一个蛋白对应一个唯一ID,同时包含了大量来自文献的蛋白质的生物功能的信息。 其次是美国的NCBI Genebank,从公共资源中获取序列数据,主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序计划。GeneBank数据库同一蛋白会有多种不同形式的ID,另外是注释信息较少。 一般情况优先推荐使用Uniprot,当研究物种在Uniprot收录蛋白较少时可使用GeneBank数据库或...查看全部>>目前来说,用的最多的是UniProt KB(Universal Protein),是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。他的数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列,每一个蛋白对应一个唯一ID,同时包含了大量来自文献的蛋白质的生物功能的信息。 其次是美国的NCBI Genebank,从公共资源中获取序列数据,主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序计划。GeneBank数据库同一蛋白会有多种不同形式的ID,另外是注释信息较少。 一般情况优先推荐使用Uniprot,当研究物种在Uniprot收录蛋白较少时可使用GeneBank数据库或其他数据库。

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