（1）在本县镇级定点医疗机构住院，医疗费用扣除起付线100元后其余可补偿70%；未办理告知手续的补偿65%。 （2）在本县县级定点医疗机构住院，医疗费用扣除起付线200元后其余可报销60%；未办理告知手续的补偿55%。
（3）在县外市内定点医疗机构住院，医疗费用扣除起付线400元后其余可报销50%；未办理转院手续的补偿45%。 （4）在汕尾市外定点医疗机构住院，医疗费用扣除起付线600元后其余可报销40%；未办理转院手续的补偿35%。
（5）起付线按住院补偿次数扣除。 （6）在本市级、县级、镇级定点医疗机构住院，须提供有关合作医疗凭证（合作医疗证、身份证或户口薄），给予免收挂号费，检查费优惠10%。 （7）住院前五天在定点医疗机构门诊部的检查治疗费用或因病情严重经抢救无效死亡的门诊（急诊）医疗费用（凭死亡证明书）可按住院的补偿标准补偿。
（8）住院医药费用补偿封顶线。根据省的要求，2009年参合农民住院医药费用补偿封顶线50000元。2、门诊补偿（1）普通门诊补偿。 2009年全市统一为每人20元，以家庭为单位，实行新的门诊补偿制度或门诊定额补偿制度。
参合农民在经审批合格的村卫生站、镇级定点医疗机构看病，村卫生站、镇级定点医疗机构对参合农民门诊看病、各项检查应给予优惠。具体管理办法由各县（市、区）政府研究制订。（2）特殊病种大额门诊补偿。 将部分慢性病、地方病、精神病等特殊病种的大额门诊费用纳入补偿范围。
特殊病种大额门诊确定为10种（①肝硬化失代偿期；②癌症（放化疗）；③慢性肾功能衰竭（尿毒症期）；④再生障碍性贫血；⑤系统性红斑狼疮；⑥规定项目组织器官移植后门诊抗排异治疗；⑦精神障碍性病症；⑧糖尿病综合症；⑨地中海贫血；⑩肺结核病（请按病性有关规定归口各县慢病站管理、诊治方可办理补偿）。
上述病种以县级以上医院鉴定为准，并出具鉴定单位的诊断证明、检查检验报告和以往或现病史病历证明。补偿起付线、报销比例与住院补偿同等待遇，住院补偿和门诊补偿累计封顶线为5万元。
白内障手术、住院分娩（按计生规定，需提供镇级计生部门的有关证明）费用纳入新农合住院补偿范围。 3、不予补偿的项目（1）伙食、陪床、超标准床位费和观察室、疗养的费用；（2）补偿手续不全者；（3）参与卖淫、嫖娼等染上性病者；（4）交通事故、医疗事故、意外人身伤害、工伤事故依法由第三者或有关单位负责的（自然灾害除外）；（5）因犯罪，打架斗殴、酗酒、吸毒、自杀、自伤自残，蓄意违章、违反法律、法规规定的其他情形等所发生的医药费用；（6）计划生育手术（按计划生育条例办理）；（7）各类生活项目开支（转院交通费、急救车费、空调费，损坏公物赔偿及陪人费）；（8）采用欺诈手段、冒名顶替的，取消当年全家新农合保障资格，不退回当年已交的保障金。
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